PubMed是一个免费的搜索引擎,主要访问MEDLINE数据库,其中包括生命科学和生物医学主题的参考文献和摘要。
欧洲PMC是一个免费在线数据库,可以获取大量不断增长的生物医学研究文献。
微软必应学术,一个在线学术搜索引擎。
BLAST将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较,并计算统计显着性,进而发现生物序列之间的相似区域。
HMMER 网络服务器,基于隐马尔科夫模型,进行快速和灵敏的生物序列同源搜索,其结果直观且可交互。
Clustal Omega是一种新的多序列比对程序,它使用种子引导树和HMM轮廓图技术生成三个或更多序列之间的比对。
UniProt提供检索相应的条目以便下载或者在线分析,还可将不同类型的标识符转换为UniProt标识符,反之亦然,并下载相关列表。
EMBOSS Seqret读取和写入(返回)序列,包括从数据库中对序列提取、显示和重新格式化,也可以产生序列的反向互补序列、序列大小写转换或上述功能的任何组合。
DAVID是一个注释、可视化和集成发现数据库,其提供了一套全面的功能注释工具,供研究人员了解大量基因背后的生物学意义。
KOBAS 3.0是用于基因/蛋白质功能注释和功能基因集富集的Web服务器。
GhostKOALA针对非冗余的KEGG GENES集合,通过GHOSTX搜索将KO标志符分配给用户的序列数据。
GO联盟的使命是开发一个从分子到代谢通路、细胞甚至生物体水平的最新的、全面的生物系统计算模型。
eggNOG-mapper是一个使用预先计算的eggNOG簇和系统发育的快速同源赋值的方法,对大量序列进行功能注释的工具。
REACTOME是一个开源的代谢通路数据库,其目标是对通路知识的可视化、解释和分析提供直观的生物信息学工具。
STRING数据库是Jensen实验室、欧洲分子生物学实验室和苏黎世大学的团队合作开发的,旨在通过合并大量蛋白质 - 蛋白质关联数据(包括已知和预测的),进而收集和整合蛋白质在细胞层面的功能信息。
BIG数据中心隶属于中科院北京基因组研究所,旨在提供生命和健康科学的多种资源,促进基础研究和产业应用。